Como aconteceu em 2012, a Série B do Campeonato Brasileiro desta temporada é disputada em pontos corridos. Os 20 times se enfrentam em dois turnos e quem somar mais pontos será o campeão.
Além do time vencedor, o segundo, terceiro e quarto colocados se classificam para a Série A de 2014.
Já as últimas quatro posições serão rebaixadas para a Série C do próximo ano.
Se ao final do torneio, os times somarem números de pontos iguais, os critérios de desempate serão:
1º) maior número de vitórias
2º) maior saldo de gols
3º) maior número de gols pró
4º) confronto direto (resultado dos jogos de ida e volta somados. Se o empate continuar, o desempate será pelo maior número de gols assinalados no campo do adversário)
5º) menor número de cartões vermelhos recebidos