No mesmo decreto em que recompôs a verba do Orçamento para a Fapesp, o governo João Doria (PSDB) admitiu que, devido a modificações no projeto de ajuste fiscal feitas para a sua aprovação, cerca de R$ 2,3 bilhões previstos em receitas não serão arrecadados.

As receitas estavam condicionadas à aprovação do projeto integral. O valor frustrado foi cortado de forma linear entre as secretarias, com exceção de saúde, educação e do Tribunal de Justiça, que tiveram redução menor. Em ofício ao governo, o deputado Paulo Fiorilo (PT) questiona o cálculo de corte.